Im Spiel „Die Blunies in: Rettet die Blunies“ übernimmt der Spieler die Rolle eines herrschenden Organs. Durch taktische Bewegung ebnet er den Bürgern den Weg auf ihrem Lebensweg. Er muss verhindern, dass sie über den linken oder rechten Rand des Bildschirms herausfallen. Gefährliche Hindernisse drohen, die Bürger anzuhalten, zu fangen oder in wütende Bürger zu verwandeln. Hindernisse können nur von den Bürgern selbst beseitigt werden.

Die acht Hauptmissionen basieren auf der Geschichte der Bundesrepublik Deutschland und bilden den roten Faden in der Erzählung des Spiels. Zufällig generierte Nebenmissionen sorgen für ein dynamisches Leveldesign und spiegeln die vielfältigen Aufgaben einer Regierung wider.